日本建设部官员川村康宏在职期间被认为大量搜集美国方面的机密，为防止对本国构成危害，美国方面派遣CIA官员跟踪川村，时刻准备夺回据说藏有机密的U盘。在行动之初，CIA发现杀手约翰·雷恩（椎名桔平 饰）也介入进来。约翰是美日混血儿，越战之后受训成为成为一名独行杀手，足迹遍布世界各地，成为令美国政府颇为头痛的人物。当川村步入地下铁时突遭心脏病身亡，而那支U盘下落不明。在此之后，CIA、日本警察、日本黑帮相继行动起来，他们共同将目光锁定在川村的女儿阿绿（长谷川京子 饰）和约翰的身上…… 本片根据美国惊悚小说名家贝瑞·艾斯勒（Barry Eisler）的处女作、也是 “杀手约翰·雷恩系列”（assassin John Rain series）的第一部改编。
雨之牙同主演影片作品